Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rnf144aQ925F3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rnf144aQ925F3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf144aQ925F3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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