Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Letmd1Q924L1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Letmd1Q924L1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms