Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clip1Q922J3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clip1Q922J3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms