Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms