Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afg3l1Q920A7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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