Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msantd4Q91YU3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms