Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc49Q91YK0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc49Q91YK0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms