Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atl3Q91YH5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms