Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Basp1Q91XV3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Basp1Q91XV3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms