Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csde1Q91W50 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csde1Q91W50 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms