Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd3Q91W18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms