Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SelenomQ8VHC3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SelenomQ8VHC3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms