Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ1

Ptgr2, Prostaglandin reductase 2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgr2Q8VDQ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ptgr2Q8VDQ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ptgr2Q8VDQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptgr2Q8VDQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptgr2Q8VDQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ptgr2Q8VDQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms