Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc92Q8VDN4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc92Q8VDN4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms