Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpm8Q8R4D5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpm8Q8R4D5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms