Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg10Q8R1P4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms