Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b4Q8QZY9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms