Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc3Q8K3W3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms