Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh16f2Q8K3M1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rdh16f2Q8K3M1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms