Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OptnQ8K3K8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OptnQ8K3K8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms