Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Depp1Q8K2F3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Depp1Q8K2F3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Depp1Q8K2F3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Depp1Q8K2F3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Depp1Q8K2F3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Depp1Q8K2F3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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