Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcf3Q8K268 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Abcf3Q8K268 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms