Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Nek9Q8K1R7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Nek9Q8K1R7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Nek9Q8K1R7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Nek9Q8K1R7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Nek9Q8K1R7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nek9Q8K1R7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Nek9Q8K1R7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Nek9Q8K1R7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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