Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sde2Q8K1J5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sde2Q8K1J5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms