Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CopaQ8CIE6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms