Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NgefQ8CHT1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NgefQ8CHT1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms