Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Upp2Q8CGR7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms