Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcerg1Q8CGF7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcerg1Q8CGF7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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