Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx8Q8CFD4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx8Q8CFD4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms