Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp27Q8CEG8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp27Q8CEG8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp27Q8CEG8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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