Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc63Q8CDV6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms