Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nsun3Q8CCT7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nsun3Q8CCT7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nsun3Q8CCT7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nsun3Q8CCT7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms