Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A430089I19RikQ8C9W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms