Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc113Q8C5T8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc113Q8C5T8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms