Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cwc22Q8C5N3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cwc22Q8C5N3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms