Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TiparpQ8C1B2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TiparpQ8C1B2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms