Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TnrQ8BYI9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TnrQ8BYI9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms