Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sall4Q8BX22 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms