Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pdcl3Q8BVF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms