Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pggt1bQ8BUY9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pggt1bQ8BUY9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pggt1bQ8BUY9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms