Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gga3Q8BMI3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gga3Q8BMI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms