Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik4Q8BMF5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms