Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zcchc4Q8BKW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zcchc4Q8BKW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms