Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup107Q8BH74 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup107Q8BH74 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms