Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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