Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpped1Q8BFS6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpped1Q8BFS6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms