Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M10.5Q85ZW7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms