Protein–RNA interactions for Protein: Q812A5

Prr5, Proline-rich protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr5Q812A5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr5Q812A5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr5Q812A5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms