Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn34b3Q80ZS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b3Q80ZS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b3Q80ZS5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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