Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ell3Q80VR2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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